Cette unité d’enseignement se focalise particulièrement sur l’expression des gènes et les modifications post-transcriptionnels chez les procaryotes et chez les eucaryotes. Suite à une introduction traitant la structure des bases azotées, la structure de l’ADN, un rappel des enzymes de restriction et de la digestion de l’ADN ainsi qu’une explication exhaustive sur le rôle des topoisomérases chez les procaryotes et les eucaryotes sont couverts. Une présentation des différents types d’ARN présents dans la cellule et de leur structure est traitée (ARNm, ARNt, ARNr, snARN, snoARN, miARN, siARN). Une description détaillée de la transcription et de la maturation des différents types d'ARN ainsi que la régulation de leur transcription chez les eucaryotes et les procaryotes est entamée. Les différentes étapes de la traduction ainsi que le bilan énergétique correspondant, chez les eucaryotes et les procaryotes, suivront. Les différents niveaux de la régulation de l’expression des gènes ainsi que la notion de l’épigénétique sont présentés pour passer par la suite à la description des différents types d’introns, des ribozymes et des intéines. Le dernier chapitre traite les différents outils enzymatiques de la biologie moléculaire qui sont discutés sous forme de TPC incluant les méthodes d’extraction de l’ARN, de la RT-PCR et de la construction d’une banque de cDNA. Les travaux pratiques commencent par une initiation au calcul et aux consignes nécessaires se rapportant à la préparation de l’équipement et du matériel nécessaires au laboratoire avant d’entamer un protocole expérimental. Ils traitent par la suite la préparation de cellules compétentes et la transformation bactérienne par divers plasmides. Une vérification par PCR sur colonie, de la présence de l’insert suivra avant de lancer une mini- prep. Cette dernière fera l’objet d’une extraction d'ADN plasmidique et d’une digestion de l'ADN extrait en vue de dresser la carte de restriction correspondante. En parallèle les étudiants sont amenés à chercher la séquence d'un gène à partir du GENBANK, l’identification de la région codante, l’étude du promoteur, faire le webcutter et dresser la carte de restriction d'un gène, analyse de la carte de différents vecteurs.

Temps présentiel : 37.5 heures

Charge de travail étudiant : 150 heures

Méthode(s) d'évaluation : Examen final, Examen final - deuxième session, Examen partiel, Exercices d'application, Exposé oral

Référence :
GENES V ; BENJAMIN LEWIN Biologie moléculaire et médecine: Jean-Claude Kaplan, Marc Delpech Biologie moléculaire de la cellule: Alberts Bruce Biologie moléculaire et cellulaire; DUNOD Maniatis